Performance of a CAD scheme applied to images obtained from mammographic film digitization and full-field digital mammography (FFDM).

This work has as purpose to compare the effects of a CAD scheme applied to digitized and \ud direct digital mamograms sets. A routine designed to be applied to mammogram in \ud DICOM standard was developed and a schema based on the Watershed Transform to \ud masses detection was applied to 252 ROIs from 130 digitized mammograms, resulting in \ud 92% of true positive and 10% of false positives. For clustered microcalcifications \ud detection, another procedure was applied to 165 ROIs from 120 mammograms, resulting in \ud 93% of true positive and 16% of false positive. By using the same procedures to 154 \ud digital mammograms obtained from FFDM, the rates have shown a little decrease in the \ud scheme performance: 89% of true positive and 16% of false positive for masses detection; \ud 90% of true positive and 27% of false positive for clusters detection. Although the tests \ud with digital mammograms have been carried with a smaller number of images and \ud different cases compared to the digitized ones, including several dense breasts images, the \ud results can be considered comparable, mainly forclustered microcalcifications detection \ud with a difference of only 3% between the sensibility rates for the both images sets. Another \ud important feature affecting these results is the contrast difference between the two images \ud set. This implies the need of extensive investigations not only with a larger number of \ud cases from FFDM but also on the parameters related to its image acquisition as well as to \ud its corresponding processing.Este trabalho tem como objetivo comparar os resultados de um esquema CAD aplicado em \ud conjunto de mamografias digitalizadas e em um conjunto de mamografias obtidas de um \ud mamógrafo digital. Para extrair as imagens do padrão DICOM, padrão utilizado pelos \ud mamógrafos digitais, uma rotina computacional foi desenvolvida. Para a detecção de \ud nódulos, um esquema baseado em Transforma Watershed foi aplicado a 252 regiões de \ud interesse (ROIs) de 130 mamografias digitalizadas, resultando em 92% de verdadeiro \ud positivo e 10%de falsos positivos. Para a detecção de microcalcificações agrupadas, outro \ud procedimento foi aplicado a165 ROIs extraídas de 120 mamografias digitalizadas, \ud resultando em 93% de verdadeiro positivo e 16% de falso positivo. Ao utilizar os mesmos \ud procedimentos para154 mamografias digitais obtidas a partir de um FFDM, as taxas \ud mostraram uma diminuição pequena no desempenho: 89% do verdadeiro positivo e 16% \ud de falso positivo para a detecção de nódulos, e 90% de verdadeiro positivo e 27% de falsos \ud positivo para a detecção de clusters de microcalcificações. Embora os testes com \ud mamografias digitais tenham sido realizados com um menor número de imagens e casos \ud diferentes em comparação com os digitalizados, incluindo várias imagens de mamas \ud densas, os resultados podem ser considerados comparáveis, principalmente para a detecção \ud de clusters de microcalcificações com uma diferença de apenas 3% entre as taxas de \ud sensibilidade para as imagens dos dois conjuntos. Outra característica importante que afeta \ud esses resultados é a diferença de contraste dos dois grupos de imagens analisados. Isto \ud implica na necessidade de extensas investigações não só com um maior número de casos \ud de mamografias digitais, mas também um estudo sobre os parâmetros relacionados a \ud aquisição da imagem, bem como para o seu processamentoCNPqFAPESPHospital of Clinics in Botucatu/S

An internet-based system for mammographic images processing and breast diagnosis aiding

Este trabalho consiste na implementação de um esquema computacional que possibilita a um usuário enviar mamografias digitalizadas/digitais via-internet para processá-las. O site, responsável pela interatividade usuário/sistema, foi desenvolvido em HTML e PHP com acesso a um banco de dados implementado em MySQL. As rotinas referentes ao pré-processamento, segmentação, classificação e geração da imagem resultante foram desenvolvidas em Delphi e são executadas de forma paralela no servidor. O sistema fornece as regiões suspeitas e com possíveis lesões detectadas na mamografia. Além da imagem com o destaque dos agrupamentos de microcalcificações detectadas, sua classificação como suspeito ou não-suspeito também são fornecidas. Para massas suspeitas detectadas, é apresentado o seu grau de densidade e as probabilidades percentuais do tipo de contorno e da classificação BIRADS. Além das mamografias, o usuário pode enviar ainda regiões de interesse (RIs). Os testes mostraram que, para o processo de detecção de microcalcificações para imagens digitalizadas, o percentual de acertos obtidos foi de 93%, enquanto para a detecção de nódulos foi de 92%. Para imagens digitais, o percentual de acertos obtidos foi de 90%, enquanto para a detecção de nódulos foi de 89%. Adicionalmente, foi verificado que o tempo médio de processamento variou entre 10 s para uma única RI e 1,5 min. para o pior caso - quatro mamografias completas. Com os testes realizados para verificar a eficácia do sistema, a usabilidade foi qualificada como fácil por mais de 70% dos 25 voluntários que o avaliaram e seu funcionamento classificado como ótimo e bom por 40% e 56% dos usuários respectivamente. Atualmente, há esquemas CAD disponíveis comercialmente, porém apresentam um alto valor para sua aquisição e uma resposta final restrita apenas à detecção de estruturas suspeitas (microcalcificações e massas nodulares), sem apresentação de dados que possam enriquecer o conjunto de informações necessárias ao radiologista para ajudá-lo no laudo. Esta pesquisa foi desenvolvida para proporcionar estas informações adicionais através da internet. Apesar dos problemas encontrados para a transmissão de imagens via-internet, os resultados apresentados através dos testes realizados pelos voluntários indicaram que o sistema possui um bom desempenho. Este sistema pode ser acessado diretamente no endereço http://143.107.235.167/CAD_Online/paginas/index.html ou através da homepage do LAPIMO (Laboratório de Análise e Processamento de Imagens Médicas e Odontológicas), do Departamento de Engenharia Elétrica da EESC/USP.This work consists of the development of a computer scheme to provide the processing of digital mammographic images sent by an internet user. The site, responsible for the interaction user/system, was developed in HTML and PHP with access to a data base implemented in MySQL. The routines of pre-processing, segmentation, classification and generation of the resultant image were developed in Delphi and are executed parallel in the server. The current system results provide indications on the suspicious mammogram regions with the detected lesions. Besides the image with convenient marks on detected clustered microcalcifications, their classification in terms of suspect or non-suspect is also provided. The density level, as well as the percentage probabilities regarding the BIRADS classification and the mass margin shapes are presented for suspicious masses detected by the scheme. In addition to the whole mammogram, the user can upload regions of interest (ROIs). Tests have shown that the correct rate of digitized mammograms was about 93% for microcalcification detection, while for mass detection, the correct rate was 92%. For direct digital mammograms, the correct rate was 93% for microcalcification detection, while for mass detection, it was 89%. In addiction, it was verified that the processing time average varied between 10 seconds (the best image case - one ROI) and 1,5 minutes for the worst image case (four complete mammograms), which this time can be considered acceptable. According to the tests performed with the purpose of checking the system efficacy, the tools manipulation was qualified as easy by more than 70% of the 25 volunteers whom have tested the system and its working classified as great and good by 40% and 56% of the users respectively. Currently, there are CAD schemes available on the market, however, they present a high acquisition cost and a final answer restricted just to the detection of suspect lesions, without providing additional data that can enhance the information the radiologists have, therefore helping them on their report. This research was carried out in order to provide this additional data by the internet. Even though some problems occurred with the transmission of images by the internet, the results presented by the tests performed by volunteers showed that the system has a good performance. This computational scheme can be accessed directly at http://143.107.235.167/CAD_Online/paginas/index.html or by the homepage of LAPIMO, the Laboratory for Medical and Odontological Images Analysis and Processing, at the Department of Electrical Engineering - EESC/USP

not available

O presente projeto consiste na implementação de um esquema computacional instalado em um site associado à homepage do Laboratório de Análise e Digitalização de Imagens, do Departamento de Engenharia Elétrica da EESC/USP, para proporcionar um procedimento de interatividade com o usuário remoto para elaboração de laudo a partir da análise de imagens mamográficas via-rede, com avaliação automática do parecer emitido. Isso foi feito a partir da implantação de um banco de imagens mamográficas digitalizadas, adequadamente pré-selecionadas, associado a uma base contendo os laudos efetivos fornecidos por radiologistas especialistas no assunto. Como o processo tem a finalidade de ser utilizado para treinamento na avaliação diagnóstica em mamografia, o laudo do especialista é disponibilizado após a finalização de cada avaliação, juntamente com o parecer fornecido pelo usuário e sua porcentagem de acerto. Esse esquema, denominado de \"Laudos Online\", objetiva também permitir ao usuário aprimorar seus conhecimentos, funcionando como uma ferramenta de ensino a distância.This work corresponds to the implementation of a computational scheme in a site inserted in the homepage of the Laboratory of Images Analysis and Digitization, at the Department of Electrical Engineering - EESC/USP - designed to provide a procedure for interaction with the remote user in order to develop the diagnosis report from mammographic images analysis through the network. This also provides the automatic evaluation relative to the given report. The scheme was developed from inserting a bank of selected digitized mammographic images, associated to a database containing the effective reports provided by radiologists. As the process is intended to be used in order to give a training on diagnostic evaluation in mammography, the specialist report is provided for comparison after ending each evaluation, together with the user report as well as his percentage of correct statements. This scheme, called \"Laudos Online\", is intended also to allow the user to enhance his knowledge, working as a distance learning tool

not available

O presente projeto consiste na implementação de um esquema computacional instalado em um site associado à homepage do Laboratório de Análise e Digitalização de Imagens, do Departamento de Engenharia Elétrica da EESC/USP, para proporcionar um procedimento de interatividade com o usuário remoto para elaboração de laudo a partir da análise de imagens mamográficas via-rede, com avaliação automática do parecer emitido. Isso foi feito a partir da implantação de um banco de imagens mamográficas digitalizadas, adequadamente pré-selecionadas, associado a uma base contendo os laudos efetivos fornecidos por radiologistas especialistas no assunto. Como o processo tem a finalidade de ser utilizado para treinamento na avaliação diagnóstica em mamografia, o laudo do especialista é disponibilizado após a finalização de cada avaliação, juntamente com o parecer fornecido pelo usuário e sua porcentagem de acerto. Esse esquema, denominado de \"Laudos Online\", objetiva também permitir ao usuário aprimorar seus conhecimentos, funcionando como uma ferramenta de ensino a distância.This work corresponds to the implementation of a computational scheme in a site inserted in the homepage of the Laboratory of Images Analysis and Digitization, at the Department of Electrical Engineering - EESC/USP - designed to provide a procedure for interaction with the remote user in order to develop the diagnosis report from mammographic images analysis through the network. This also provides the automatic evaluation relative to the given report. The scheme was developed from inserting a bank of selected digitized mammographic images, associated to a database containing the effective reports provided by radiologists. As the process is intended to be used in order to give a training on diagnostic evaluation in mammography, the specialist report is provided for comparison after ending each evaluation, together with the user report as well as his percentage of correct statements. This scheme, called \"Laudos Online\", is intended also to allow the user to enhance his knowledge, working as a distance learning tool

Quantificação e análise espacial dos focos de calor no Parque Nacional da Chapada Diamantina - BA

Fires in vegetation are pointed out as one of the main factors that impact and threaten the conservation of biodiversity in environmental systems. In Brazil, in the state of Bahia, Chapada Diamantina is one of the most affected region by constant burning, requiring huge investment of financial resources to fight the fires. Hotspots data detected by satellite sensors have been used to identify areas of occurrence of fires. From these data, estimates are made about the possible location and extent of affected areas, highlighting the temporal / spatial dynamic of fires. This study aimed to analyze the spatial behavior of hotspots between the years 2000 to 2011 in the National Park of Chapada Diamantina, in order to identify the areas of greatest intensity of fire occurrence obtained with the aid of Kernel intensity estimation. To this end, was made a survey of georeferenced hotspots existing into the park, organized a database, and then, in a GIS environment, modeled the distribution pattern of the set of points. According to the analyzed data, about 439 hotspots were detected by sensors aboard NOAA satellites - NOAA 12 and - 15 in the last 12 years within the park boundaries. It was found that the year of higher incidence of hot spots in the park was in 2008, when 243 focuses were detected. The number of hotspots recorded in 2008 represents about 55% of the total. It was found that 245 of the 439 spots detected were in the east border of the city of Mucugê (about 56%).Pages: 6969-697